تتبع مباشرة مجلس الأمناء وهي الجهاز التنفيذي الذي يضع اللوائح والنظم الداخلية اللازمة وينسق كافة خطط وبرامج وانشطة الجائزة المختلفة، بالإضافة الي اقتراح ووضع موضوعات الجائزة والشروط الخاصة بالجوائز العلمية.وتشمل عضوية الامانة العامة رؤساء اللجان الرئيسية ورؤساء مراكز الأنشطة في الجائزة.
سعادة الأستاذ الدكتور نجيب الخاجة
عضو مجلس الأمناء
الأمين العام
سعادة الدكتور أحمد الهاشمي
رئيس اللجنة الوطنية لمكافحة المنشطات
عضو مجلس الأمناء
رئيس اللجنة المالية
سعادة الأستاذ الدكتور سهام الدين كلداري
رئيس اللجنة العلمية للبحوث
سعادة الدكتور محمود طالب العلي
مدير المركز العربي للدراسات الجينية
سعادة الأستاذ الدكتور يوسف عبدالرزاق
رئيس اللجنة العلمية للجوائز
سعادة الأستاذ عبدالله بن سوقات
المدير التنفيذي
